Мяркинский краеведческий музей расположился в бывшей церкви, построенной в 1888 году в период царской оккупации на месте снесённой Мяркинской городской ратуши в стиле ренессанса, которая 300 лет украшала центр населённого пункта. Церковь возведена из кирпича старой ратуши.

Мяркинский музей ведёт свою историю с 1956 года, когда по инициативе учителя Юозаса Виткуса в Мяркинской средней школе была открыта первая экспозиция антикварных вещей. В 1968 году постоянно пополняющаяся коллекция музея была перенесена в закрытую в годы Второй мировой войны церковь.

В 2013 году Мяркинский музей открылся после обновления экспозиции, в которой представлено следующее:

относящиеся к каменному, медному и железному векам археологические артефакты, свидетельствующие о первых поселениях в окрестностях Мяркине;
напоминающий о былой славе города Мяркине в XVI-XVIII века отлитый Яном Деламарсом в Вильнюсе в 1670 году красивый колокол Мяркинской ратуши; прекрасная коллекция фаянса; другие археологические находки; макет исторической ратуши;
экспонаты (молитвенники, фотографии, документы, личные вещи) конца XIX века – начала XX века, повествующие о жизни жителей Мяркине и окрестных мест в свете сложных исторических событий;
документы, фотографии, оружие и прочие музейные ценности XX века, свидетельствующие о периодах оккупации, холокосте, ссылках и борьбе литовских партизан за свободу Родины.

В музее Вы не только увидите отвечающую современным требованиям экспозицию, выбранный Вами фильм из видеотеки, но и сможете услышать окутанные легендами рассказы о смерти короля Польши и Великого князя Литовского Владислава Вазы IV в Мяркине в 1648 году, о проведённой литовскими партизанами атаке на Мяркине в 1945 году и о других важных для данного региона событиях...